La flora y la fauna en la provincia de Marañón está determinada por las regiones naturales que posee, entre ellas yunga fluvial, quechua, suni, puna y selva alta, existen especies propias de las diferentes regiones naturales a continuación se mencionan las mas representativas

Yunga Fluvial

Una parte del territorio comprendido por debajo de los 2300 msnm, existen localidades en esta región tales como Mamahuaje, Huambo, Potrero en la cuenca del Río Marañón y Santa Rosa de Oso, Nueva Galilea, Ají entre otros en la cuenca del Huallaga, esta región esta caracterizada por su variada flora y fauna, entre las especies representativas tenemos:

El molle, huarango, tara, achupalla, cactus, maguey, sábila, cabuya blanca y azul, pitajaya, elechos, líquenes una grán variedad de árboles y pastizales, en estas zonas prosperan los árboles frutales tales como el palto, guayago, pacae, chirimoya, entre otros.

Las especies animales que habitan estas zonas son: oso negro, comadreja, puma, algunas especies de monos, zorro, trucha, bagre, entre otros